內參是由管家基因編碼表達的蛋白,它們在各組織和細胞中表達相對恒定。主要用來校正蛋白質定量、上樣過程中存在的誤差,從而保證實驗結果的準確性。也可以作為空白對照,檢測蛋白轉膜情況是否完全、整個蛋白免疫印跡顯色發(fā)光體系是否正常。內參抗體種類很多,常見的內參抗體包括β-actin、β-tubulin、GAPDH等,那么我們該如何選擇合適的內參抗體呢?
樣本種屬來源:
? 哺乳動物的組織或者細胞樣本通常選擇β-actin、β-tubulin、GAPDH、HistoneH3等
? 植物樣本則可以選擇actin、Rubisco等
? 研究者也需要參照文獻報導,選擇合適的蛋白作為內參
目的蛋白表達部位:
? 全細胞蛋白檢測一般用GAPDH、β-actin、β-tubulin等抗體作為內參。而針對于核蛋白的定量,特別是樣本蛋白就是核蛋白時,選擇恰當?shù)暮说鞍變葏t更能體現(xiàn)內部參照的價值。常用的核內參抗體有Lamin A、Lamin B、Histone H3;除此之外,其它常見的核蛋白內參還有PCNA、K70、K80等;在一些文獻報道中,ERK2、TATA binding protein (TBP) 以及c-Jun、c-Fos等都有使用。而對于膜蛋白檢測,常用的內參抗體為Na+ /K+-ATPase。
? 對于一些植物的樣本,則需要特別的植物Actin蛋白作為內參。當實驗樣品中只是核蛋白,而不是細胞總蛋白提取液時,可以用組蛋白H(Histone H),或者增殖細胞核抗原(PCNA)等作為核內參抗體。對于線粒體蛋白的檢測,常用COX IV或VDAC1作為內參抗體,這里面COX IV又是被引用最多的線粒體內參。對于葉綠體蛋白的檢測,常用Rubisco作為內參。
目的蛋白大?。?/span>
選擇內參抗體時應考慮目的蛋白分子量大小,通常保證目的蛋白與內參蛋白分子量相差5kDA以上
蛋白表達要恒穩(wěn):
挑選的內參是否會受實驗變化影響。例如,GAPDH是常用的內參,但在缺氧和糖尿病等疾病存在下,會增加GAPDH在特定細胞和組織中的表達,在代謝糖酵解的研究中就不適合作為內參。
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